Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms