Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ6

Fbxo42, F-box only protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo42Q6PDJ6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fbxo42Q6PDJ6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fbxo42Q6PDJ6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms