Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SvoplQ6PDF3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SvoplQ6PDF3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms