Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhb9Q6PB60 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms