Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atl2Q6PA06 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl2Q6PA06 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms