Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nwd2Q6P5U7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nwd2Q6P5U7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nwd2Q6P5U7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nwd2Q6P5U7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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