Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga3Q6NZL0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Soga3Q6NZL0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms