Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf9bQ6NZA9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf9bQ6NZA9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms