Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Szrd1Q6NXN1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Szrd1Q6NXN1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms