Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rprd2Q6NXI6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms