Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HelbQ6NVF4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms