Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CltbQ6IRU5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CltbQ6IRU5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms