Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Tpm4Q6IRU2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tpm4Q6IRU2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms