Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best3Q6H1V1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Best3Q6H1V1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms