Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nckap5lQ6GQX2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms