Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbf1Q6DFZ1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbf1Q6DFZ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms