Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q6DFW0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms