Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
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Ddx11Q6AXC6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Ddx11Q6AXC6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Ddx11Q6AXC6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Ddx11Q6AXC6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx11Q6AXC6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx11Q6AXC6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Ddx11Q6AXC6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx11Q6AXC6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddx11Q6AXC6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx11Q6AXC6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddx11Q6AXC6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Ddx11Q6AXC6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms