Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Cep290Q6A078 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Cep290Q6A078 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep290Q6A078 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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