Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kiaa1549Q68FD9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms