Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp4eQ66X19 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp4eQ66X19 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp4eQ66X19 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4eQ66X19 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4eQ66X19 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4eQ66X19 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4eQ66X19 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4eQ66X19 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4eQ66X19 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4eQ66X19 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4eQ66X19 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4eQ66X19 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms