Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BC080695Q66JY9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BC080695Q66JY9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms