Protein–RNA interactions for Protein: Q64522

Hist2h2ab, Histone H2A type 2-B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2abQ64522 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hist2h2abQ64522 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Hist2h2abQ64522 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hist2h2abQ64522 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hist2h2abQ64522 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms