Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col4a5Q63ZW6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a5Q63ZW6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms