Protein–RNA interactions for Protein: Q63739

Ptp4a1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a1Q63739 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ptp4a1Q63739 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ptp4a1Q63739 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ptp4a1Q63739 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ptp4a1Q63739 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ptp4a1Q63739 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ptp4a1Q63739 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ptp4a1Q63739 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ptp4a1Q63739 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ptp4a1Q63739 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptp4a1Q63739 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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