Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga3Q62470 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga3Q62470 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms