Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Gm20854Q62461 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Gm20854Q62461 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Gm20854Q62461 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Gm20854Q62461 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Gm20854Q62461 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Gm20854Q62461 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20854Q62461 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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