Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tff3Q62395 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tff3Q62395 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms