Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Supt6hQ62383 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Supt6hQ62383 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms