Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sprr1bQ62267 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sprr1bQ62267 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sprr1bQ62267 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sprr1bQ62267 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sprr1bQ62267 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sprr1bQ62267 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sprr1bQ62267 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sprr1bQ62267 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sprr1bQ62267 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sprr1bQ62267 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms