Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sall3Q62255 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sall3Q62255 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms