Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tgfb1i1Q62219 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgfb1i1Q62219 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms