Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpaQ62189 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms