Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms