Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtafrQ62035 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtafrQ62035 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms