Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itga6Q61739 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms