Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd47Q61735 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd47Q61735 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms