Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccne1Q61457 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne1Q61457 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms