Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd3Q61060 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxd3Q61060 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms