Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms