Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms