Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Neurod1Q60867 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms