Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf3Q60803 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms