Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms