Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcf4Q60722 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms