Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp13a3Q5XF89 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms