Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tdrd5Q5VCS6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms