Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scaf1Q5U4C3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms