Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NotoQ5TIS6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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