Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWZ9

Pld6, Mitochondrial cardiolipin hydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld6Q5SWZ9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pld6Q5SWZ9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pld6Q5SWZ9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms